XLS和XLSX是Excel电子表格软件中常见的两种文件格式，它们在文件结构、版本、兼容性、大小性能以及安全性方面存在显著差异，以下是对这两种格式的详细比较：

XLS文件

1、定义：XLS是Excel 2003及早期版本的默认文件格式，它是一个特有的二进制格式，核心结构是基于复合文档类型结构。

2、兼容性：XLS格式的文件在不同电子表格应用程序之间的互操作性相对较差，它是专为特定版本的Excel设计的，并采用了与常规文档不同的结构方式，由于其年代久远，许多老版本的软件都能很好地兼容它，包括一些业务、数据系统。

3、功能限制：XLS文件的工作表大小受限，列数最多只能达到256列，而行数最多为65,536行，它不支持Excel 2007后引入的诸多高级功能，如条件格式的高级应用、数据透视表的增强等。

4、文件大小：由于采用二进制存储方式，XLS文件的体积相对较大。

5、安全性：XLS文件的安全性相对较低，因为它的结构较为封闭，不容易进行加密处理。

XLSX文件

1、定义：XLSX是Excel 2007/2010/2013/2016/2019文档的扩展名，它基于Office Open XML标准，是一种压缩的XML文件格式，这意味着它的结构更加清晰，易于被其他应用程序读取和写入。

2、兼容性：XLSX文件具有良好的向下兼容性，即较新版本的Excel可以打开和编辑旧版（如Excel 2007之前版本）创建的XLS文件，但旧版本的Excel可能无法直接打开或编辑以XLSX格式保存的文件，除非安装兼容包。

3、功能支持：XLSX格式提供了更多的功能和可扩展性，它支持多达1,048,576行和16,384列，极大地扩展了数据处理能力，它还支持更多的高级功能，如条件格式的高级应用、数据透视表的增强、复杂公式的运用等。

4、文件大小：由于采用了压缩技术，XLSX文件通常比XLS文件体积更小，这在数据传输和存储方面具有明显优势，它的打开和保存速度也更快。

5、安全性：XLSX格式提供了更高级别的安全性支持，用户可以为XLSX文件设置加密和数字签名，确保数据的安全性，通过分层结构，数据和样式信息得以分离存储，减少了恶意软件攻击的风险。

XLS和XLSX在文件格式、兼容性、功能、大小性能以及安全性等方面均存在显著差异，在选择使用哪种格式时，需要根据实际需求和场景来判断，如果是需要与旧版软件兼容或对安全性要求不高的场景，可以选择XLS格式；如果需要处理大量数据、使用高级功能或对安全性有较高要求的场景，则更适合选择XLSX格式。