如果支付宝商家收款二维码被别人扫码付款后，想追回款项，可以参考以下方法：

1、联系收款方协商：尝试通过电话、短信或其他通讯方式与误付的对方取得联系，说明情况并请求对方退还款项，沟通时要保持诚恳的态度，尽量动之以情晓之以理，以增加对方同意退款的可能性。

2、联系支付宝客服：如果与付款方协商无果，可以联系支付宝客服，向其说明情况，提供交易的相关证据和信息，如交易时间、金额、付款方账号等，支付宝客服会对情况进行核实和处理。

3、报警处理：若收款方拒绝退款且涉及金额较大，构成了不当得利，可以选择报警，根据法律规定，不当得利者有义务返还其所得的不当利益，公安机关会根据具体情况进行调查和处理。

当遇到支付宝商家收款二维码被他人扫码付款的情况时，应首先尝试自行联系付款方解决；若无法解决，再寻求支付宝官方或警方的帮助，同时要注意保留好相关的交易记录作为证据，以便更好地维护自己的合法权益。